《秘密花園》的小主人公瑪麗雖然自小與父母一起生活在印度，但并未享受過來自父母的親情；土著仆人的百依百順，使她變得乖戾而別扭。一場霍亂讓她一夜之間變成了孤兒，被送回英國的姑父家寄養。在親戚家的大莊園里，瑪麗在知更鳥的引領下，發現了一座廢棄已久的秘密花園，并情不自禁地愛上了這座花園。她與小伙伴迪肯、柯林一起在花園里蒔花弄草，并與狐貍、烏鴉、松鼠、羊羔和小馬為伴，在這座花園逐漸恢復生機的同時，瑪麗和柯林也改掉了自身的壞毛病，瑪麗變成了漂亮的小姑娘，柯林也成長為健壯的小伙子。他們把這一切的一切，都歸功于大自然的魔法。