生活在龍眼島上的海博士長期從事海洋科學研究。由于全球溫室氣體不斷增加，海嘯、地震、酸雨等自然災害頻發，從浩瀚的海洋中尋找固碳和儲碳的媒介，成為他思索的方向。恰在此時，一位漁民機緣巧合撿到一個神秘石蛋，海博士一眼判斷這是具有高固碳能力的墨龍蛋。得知墨龍蛋是在馬里亞納海溝附近發現，于是，海博士帶領兩位少年助手，駕駛科考艇--“龍眼”號，前往世界深淵尋找神秘的固碳鑰匙--墨龍，由此開啟一趟神奇的海底冒險之旅……