一場洪水即將到來，所有的動物唯有登上一艘大船才能獲救。三只企鵝，卻只得到兩張船票，他們必須做出抉擇：是拋棄自己的好朋友小企鵝，還是想盡辦法與他共渡難關？最終，兩只企鵝決定用手提箱把小企鵝偷帶上船。在接下來四十天的冒險旅程中，三只企鵝與鴿子展開了一場斗智斗勇的博弈……