馬林和尼莫是一對可愛的小丑魚父子，他們生活在美麗的大堡礁。膽小謹慎的馬林總是對兒子過度保護，生怕他受到一丁點傷害。尼莫對這個“膽小鬼”爸爸有很多不滿和抱怨。在一次爭執中，尼莫被潛水員捉住并帶到了人類世界。為了拯救唯一的兒子，馬林鼓起勇氣，開始了一場尋找尼莫的奇幻之旅。