小女孩瑪麗因為一場突來的霍亂，變成了孤兒，被親戚收養，來到了一處莊園生活。莊園的少主人科林長年臥病在床，性情乖戾難測。為了幫助科林，瑪麗帶他進入了莊園里被關閉多年的秘密花園。孩子們在生機蓬勃的小天地里不受干擾地玩耍，學會了友愛待人，恢復了純真快樂的天性。